Налогоплательщик на ОСНО должен ежеквартально уплачивать налог на прибыль и подавать декларацию. Перечислять платеж можно частями, ежемесячно.
Подавать декларацию нужно не позднее 25 числа месяца, следующего за истекшим кварталом, а перечислять платеж — до 28 числа того же месяца с учетом времени на зачисление.
В конце отчетного периода бухгалтер создает документ «Расчет налога на прибыль» — СБИС рассчитывает сумму налога к уплате на основании проведенных документов.
Перед тем как создать документ расчета налога, убедитесь, что каждый месяц квартала закрыт.
Создайте регламентные операции и проверьте настройки системы.
- Создайте регламентные операции «Закрытие затратных счетов» и «Определение финансового результата». В разделе «Учет/Операции/Закрытие месяца» нажмите
и выберите «Закрытие месяца/Закрытие затратных счетов». Проведите документ. 
Тем же способом создайте и проведите «Определение финансового результата».
- Если вы впервые рассчитываете налог на прибыль в СБИС, убедитесь, что в настройках установлена «Общая система налогообложения». Для этого откройте раздел «Настройки/Параметры учета». Название организации должно отображаться в блоке «ОСНО с НДС».
и выберите «Закрытие месяца/Закрытие затратных счетов». Проведите документ. 
Итог: система настроена правильно, регламентные операции созданы. Создайте расчет.
Также об этом мы говорили на вебинаре «Как рассчитать НДС и налог на прибыль».