Если ваши покупатели — не организации или ИП, нет строгой обязанности выставлять им счета-фактуры, в том числе при получении аванса.
Теперь Saby учитывает НДС по авансам от физлиц в новом документе: «НДС на розничный аванс». В том числе при реализации подарочных сертификатов. Изменение никак не повлияет на заполнение декларации.

В разделе «Налоги → НДС» собрали все, что нужно для расчета: документы по НДС с авансов и книги продаж и покупок.

Исходящие и входящие счета-фактуры находятся в разделах «Продажи» и «Закупки».

Подробнее об учете НДС с авансов — в базе знаний.